El Moncofa Futbol Club va naixer oficialment el 8 d´agost de 1952, quan la Junta Directiva encapçalada per José Masià Latorre va inscriure l´equip a la Federació Valenciana de Futbol. 

Des de llavors el Moncofa FC ha alternat la seua participació sobre tot a Primera i Segona regional. Exactament 25 temporades a Primera Regional i 27 a Segona. Havent disputat dues en Regional Preferent les temporades, 84-85 i 85-86. La resta fins a les 64 les ha disputat en tercera regional, o com es el cas de la segona meitat dels seixanta o les temporades 87-88 i 93-94 no va haver equip representatiu en categoria aficionat.

En l´actualitat l´equip està consolidat a Primera Regional, categoria en la que ha disputat 15 dels ultims 18 campionats lliguers.

En aquesta categoria disputarà la propera temporada, que serà la sisena consecutiva.